2019年6月,SCI学术期刊《G3:Genes|Genomes|Genetics》正式发表公司细菌基因组学和传染性疾病课题组的最新研究成果《Systematic Analysis of Metabolic Pathway Distributions of Bacterial Energy Reserves》。该项课题利用隐马尔可夫序列模型,深入挖掘了8282个细菌参考蛋白组中能量储备代谢通路和关键酶的同源性,并对它们的分布模式在系统进化水平进行了分析。这项研究揭示了特定的代谢途径和关键酶被限定在特定类型的细菌种群中,从进化角度阐述了能量代谢通路的可能起源和生理功能。能量代谢与病原菌的环境生存能力及其毒性均有密切关系。该研究对细菌能量代谢的进一步实验研究具有指导意义。
本项目得到3044am永利集团3044noc优秀人才启动基金(D2016007)、江苏省双创计划(2017)、以及江苏省自然科学基金(BK20180997)资助。生物信息学专业2016级本科生杨健叶为第二作者,2015级本科生黄悦和2016级本科生许亚苹为共同作者,王亮博士为通讯作者及第一作者。
图1 能量代谢通路及关键酶在系统进化水平的分布模式